[svn-r8619] Purpose:

    Fix makefiles, dependencies & manifest after source file rename.

9 files changed, 291 insertions, 222 deletions

diff --git a/MANIFEST b/MANIFEST
index 3c50b13..d4db4c9 100644
--- a/MANIFEST
+++ b/MANIFEST
@@ -846,22 +846,22 @@
 ./src/H5Bprivate.h
 ./src/H5Bpublic.h
 ./src/H5D.c
+./src/H5Dcontig.c
+./src/H5Dcompact.c
 ./src/H5Dio.c
+./src/H5Distore.c
 ./src/H5Dprivate.h
 ./src/H5Dpublic.h
 ./src/H5Dpkg.h
+./src/H5Dseq.c
 ./src/H5Dtest.c
 ./src/H5E.c
 ./src/H5Eprivate.h
 ./src/H5Epublic.h
 ./src/H5F.c
-./src/H5Fcontig.c
-./src/H5Fcompact.c
-./src/H5Fistore.c
 ./src/H5Fpkg.h
 ./src/H5Fprivate.h
 ./src/H5Fpublic.h
-./src/H5Fseq.c
 ./src/H5FD.c
 ./src/H5FDcore.c
 ./src/H5FDcore.h
diff --git a/perform/Dependencies b/perform/Dependencies
index 6f96f50..c64e6d0 100644
--- a/perform/Dependencies
+++ b/perform/Dependencies
@@ -224,7 +224,13 @@ pio_perf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
+   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.h \
+   $(srcdir)/pio_perf.h \
+   $(srcdir)/pio_timer.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5private.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
+   $(top_srcdir)/test/h5test.h
 pio_engine.lo: \
    $(srcdir)/pio_engine.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
@@ -260,7 +266,12 @@ pio_engine.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
+   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
+   $(srcdir)/pio_perf.h \
+   $(srcdir)/pio_timer.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5private.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
+   $(top_srcdir)/test/h5test.h
 pio_timer.lo: \
    $(srcdir)/pio_timer.c \
    $(srcdir)/pio_timer.h \
@@ -297,4 +308,8 @@ pio_timer.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
+   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
+   $(srcdir)/pio_perf.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5private.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
+   $(top_srcdir)/test/h5test.h
diff --git a/src/Dependencies b/src/Dependencies
index 7327cfc..7bceaab 100644
--- a/src/Dependencies
+++ b/src/Dependencies
@@ -153,24 +153,38 @@ H5B.lo: \
    $(srcdir)/H5Bpkg.h \
    $(srcdir)/H5Bprivate.h \
    $(srcdir)/H5Bpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Dprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Dpublic.h \
+   $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
+   $(srcdir)/H5FDmpio.h \
+   $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
+   $(srcdir)/H5Oprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Opublic.h \
+   $(srcdir)/H5Spublic.h \
+   $(srcdir)/H5HGprivate.h \
+   $(srcdir)/H5HGpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Tprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Tpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Gprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Gpublic.h \
+   $(srcdir)/H5RSprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Rprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Rpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Zprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Zpublic.h \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
    $(srcdir)/H5Fpkg.h \
    $(srcdir)/H5FOprivate.h \
    $(srcdir)/H5TBprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Gprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Gpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Opublic.h \
-   $(srcdir)/H5RSprivate.h \
    $(srcdir)/H5FLprivate.h \
    $(srcdir)/H5Iprivate.h \
    $(srcdir)/H5MFprivate.h \
    $(srcdir)/H5FDprivate.h \
-   $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
-   $(srcdir)/H5FDmpio.h \
-   $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
    $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h
 H5D.lo: \
    $(srcdir)/H5D.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
@@ -221,8 +235,8 @@ H5D.lo: \
    $(srcdir)/H5Iprivate.h \
    $(srcdir)/H5MMprivate.h \
    $(srcdir)/H5Vprivate.h
-H5Dio.lo: \
-   $(srcdir)/H5Dio.c \
+H5Dcontig.lo: \
+   $(srcdir)/H5Dcontig.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
    $(srcdir)/H5public.h \
    H5pubconf.h \
@@ -264,88 +278,60 @@ H5Dio.lo: \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
    $(srcdir)/H5FDprivate.h \
    $(srcdir)/H5FLprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Iprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5TBprivate.h \
+   $(srcdir)/H5MFprivate.h \
    $(srcdir)/H5Vprivate.h
-H5E.lo: \
-   $(srcdir)/H5E.c \
+H5Dcompact.lo: \
+   $(srcdir)/H5Dcompact.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
    $(srcdir)/H5public.h \
    H5pubconf.h \
    $(srcdir)/H5api_adpt.h \
    $(srcdir)/H5MPprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Iprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
-   $(srcdir)/H5Eprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Epublic.h \
-   $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h
-H5F.lo: \
-   $(srcdir)/H5F.c \
-   $(srcdir)/H5FDcore.h \
+   $(srcdir)/H5Dpkg.h \
+   $(srcdir)/H5Dprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Dpublic.h \
    $(srcdir)/H5Ipublic.h \
-   $(srcdir)/H5public.h \
-   H5pubconf.h \
-   $(srcdir)/H5api_adpt.h \
-   $(srcdir)/H5FDfamily.h \
    $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
    $(srcdir)/H5FDmpio.h \
    $(srcdir)/H5FDpublic.h \
    $(srcdir)/H5Fpublic.h \
-   $(srcdir)/H5FDgass.h \
-   $(srcdir)/H5FDlog.h \
    $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
-   $(srcdir)/H5FDmulti.h \
-   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
-   $(srcdir)/H5Dpublic.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Zpublic.h \
-   $(srcdir)/H5FDsec2.h \
-   $(srcdir)/H5FDsrb.h \
-   $(srcdir)/H5FDstdio.h \
-   $(srcdir)/H5FDstream.h \
-   $(srcdir)/H5private.h \
-   $(srcdir)/H5MPprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Aprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Apublic.h \
+   $(srcdir)/H5Oprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Opublic.h \
+   $(srcdir)/H5Spublic.h \
+   $(srcdir)/H5HGprivate.h \
+   $(srcdir)/H5HGpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Tprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Tpublic.h \
    $(srcdir)/H5Gprivate.h \
    $(srcdir)/H5Gpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Opublic.h \
    $(srcdir)/H5Bprivate.h \
    $(srcdir)/H5Bpublic.h \
    $(srcdir)/H5ACprivate.h \
    $(srcdir)/H5ACpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
    $(srcdir)/H5RSprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Dprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Oprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Spublic.h \
-   $(srcdir)/H5HGprivate.h \
-   $(srcdir)/H5HGpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Tprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Tpublic.h \
    $(srcdir)/H5Rprivate.h \
    $(srcdir)/H5Rpublic.h \
    $(srcdir)/H5Zprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Zpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
-   $(srcdir)/H5Fpkg.h \
-   $(srcdir)/H5FOprivate.h \
-   $(srcdir)/H5TBprivate.h \
    $(srcdir)/H5FDprivate.h \
    $(srcdir)/H5FLprivate.h \
-   $(srcdir)/H5FPprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Iprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Pprivate.h
-H5Fcontig.lo: \
-   $(srcdir)/H5Fcontig.c \
+   $(srcdir)/H5Vprivate.h
+H5Dio.lo: \
+   $(srcdir)/H5Dio.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
    $(srcdir)/H5public.h \
    H5pubconf.h \
    $(srcdir)/H5api_adpt.h \
    $(srcdir)/H5MPprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Dpkg.h \
    $(srcdir)/H5Dprivate.h \
    $(srcdir)/H5Dpublic.h \
    $(srcdir)/H5Ipublic.h \
@@ -373,117 +359,120 @@ H5Fcontig.lo: \
    $(srcdir)/H5Rpublic.h \
    $(srcdir)/H5Zprivate.h \
    $(srcdir)/H5Zpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
-   $(srcdir)/H5Fpkg.h \
-   $(srcdir)/H5FOprivate.h \
-   $(srcdir)/H5TBprivate.h \
    $(srcdir)/H5FDprivate.h \
    $(srcdir)/H5FLprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MFprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Iprivate.h \
+   $(srcdir)/H5MMprivate.h \
+   $(srcdir)/H5TBprivate.h \
    $(srcdir)/H5Vprivate.h
-H5Fcompact.lo: \
-   $(srcdir)/H5Fcompact.c \
+H5Distore.lo: \
+   $(srcdir)/H5Distore.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
    $(srcdir)/H5public.h \
    H5pubconf.h \
    $(srcdir)/H5api_adpt.h \
    $(srcdir)/H5MPprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Eprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Epublic.h \
-   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
-   $(srcdir)/H5Fpkg.h \
-   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Fpublic.h \
-   $(srcdir)/H5FDpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Bpublic.h \
-   $(srcdir)/H5FOprivate.h \
-   $(srcdir)/H5TBprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Gprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Gpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Opublic.h \
+   $(srcdir)/H5Bpkg.h \
    $(srcdir)/H5Bprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Bpublic.h \
    $(srcdir)/H5ACprivate.h \
    $(srcdir)/H5ACpublic.h \
-   $(srcdir)/H5RSprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Oprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Fpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
+   $(srcdir)/H5FDpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Dpkg.h \
+   $(srcdir)/H5Dprivate.h \
    $(srcdir)/H5Dpublic.h \
+   $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
+   $(srcdir)/H5FDmpio.h \
+   $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
+   $(srcdir)/H5Oprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Opublic.h \
    $(srcdir)/H5Spublic.h \
    $(srcdir)/H5HGprivate.h \
    $(srcdir)/H5HGpublic.h \
    $(srcdir)/H5Tprivate.h \
    $(srcdir)/H5Tpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Gprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Gpublic.h \
+   $(srcdir)/H5RSprivate.h \
    $(srcdir)/H5Rprivate.h \
    $(srcdir)/H5Rpublic.h \
    $(srcdir)/H5Zprivate.h \
    $(srcdir)/H5Zpublic.h \
-   $(srcdir)/H5FDprivate.h \
-   $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
-   $(srcdir)/H5FDmpio.h \
-   $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
+   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Eprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Epublic.h \
    $(srcdir)/H5FLprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Iprivate.h \
+   $(srcdir)/H5MFprivate.h \
+   $(srcdir)/H5FDprivate.h \
+   $(srcdir)/H5MMprivate.h \
    $(srcdir)/H5Vprivate.h
-H5Fistore.lo: \
-   $(srcdir)/H5Fistore.c \
+H5Dseq.lo: \
+   $(srcdir)/H5Dseq.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
    $(srcdir)/H5public.h \
    H5pubconf.h \
    $(srcdir)/H5api_adpt.h \
    $(srcdir)/H5MPprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Bpkg.h \
-   $(srcdir)/H5Bprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Bpublic.h \
-   $(srcdir)/H5ACprivate.h \
-   $(srcdir)/H5ACpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Fpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
-   $(srcdir)/H5FDpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Dpkg.h \
    $(srcdir)/H5Dprivate.h \
    $(srcdir)/H5Dpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
    $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
    $(srcdir)/H5FDmpio.h \
+   $(srcdir)/H5FDpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Fpublic.h \
    $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
    $(srcdir)/H5Oprivate.h \
    $(srcdir)/H5Opublic.h \
    $(srcdir)/H5Spublic.h \
    $(srcdir)/H5HGprivate.h \
    $(srcdir)/H5HGpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
    $(srcdir)/H5Tprivate.h \
    $(srcdir)/H5Tpublic.h \
    $(srcdir)/H5Gprivate.h \
    $(srcdir)/H5Gpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Bprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Bpublic.h \
+   $(srcdir)/H5ACprivate.h \
+   $(srcdir)/H5ACpublic.h \
    $(srcdir)/H5RSprivate.h \
    $(srcdir)/H5Rprivate.h \
    $(srcdir)/H5Rpublic.h \
    $(srcdir)/H5Zprivate.h \
    $(srcdir)/H5Zpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
-   $(srcdir)/H5Fpkg.h \
-   $(srcdir)/H5FOprivate.h \
-   $(srcdir)/H5TBprivate.h \
-   $(srcdir)/H5FLprivate.h \
+   $(srcdir)/H5FDprivate.h \
    $(srcdir)/H5Iprivate.h \
    $(srcdir)/H5MFprivate.h \
-   $(srcdir)/H5FDprivate.h \
    $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
-   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
    $(srcdir)/H5Vprivate.h
-H5Fseq.lo: \
-   $(srcdir)/H5Fseq.c \
+H5Dtest.lo: \
+   $(srcdir)/H5Dtest.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
    $(srcdir)/H5public.h \
    H5pubconf.h \
    $(srcdir)/H5api_adpt.h \
    $(srcdir)/H5MPprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Dpkg.h \
    $(srcdir)/H5Dprivate.h \
    $(srcdir)/H5Dpublic.h \
    $(srcdir)/H5Ipublic.h \
@@ -511,19 +500,84 @@ H5Fseq.lo: \
    $(srcdir)/H5Rpublic.h \
    $(srcdir)/H5Zprivate.h \
    $(srcdir)/H5Zpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Sprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Eprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Epublic.h \
+   $(srcdir)/H5Iprivate.h
+H5E.lo: \
+   $(srcdir)/H5E.c \
+   $(srcdir)/H5private.h \
+   $(srcdir)/H5public.h \
+   H5pubconf.h \
+   $(srcdir)/H5api_adpt.h \
+   $(srcdir)/H5MPprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Iprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
+   $(srcdir)/H5Eprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Epublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMprivate.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h
+H5F.lo: \
+   $(srcdir)/H5F.c \
+   $(srcdir)/H5FDcore.h \
+   $(srcdir)/H5Ipublic.h \
+   $(srcdir)/H5public.h \
+   H5pubconf.h \
+   $(srcdir)/H5api_adpt.h \
+   $(srcdir)/H5FDfamily.h \
+   $(srcdir)/H5FDfphdf5.h \
+   $(srcdir)/H5FDmpio.h \
+   $(srcdir)/H5FDpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Fpublic.h \
+   $(srcdir)/H5FDgass.h \
+   $(srcdir)/H5FDlog.h \
+   $(srcdir)/H5FDmpiposix.h \
+   $(srcdir)/H5FDmulti.h \
+   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
+   $(srcdir)/H5Dpublic.h \
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Zpublic.h \
+   $(srcdir)/H5FDsec2.h \
+   $(srcdir)/H5FDsrb.h \
+   $(srcdir)/H5FDstdio.h \
+   $(srcdir)/H5FDstream.h \
+   $(srcdir)/H5private.h \
+   $(srcdir)/H5MPprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Aprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Apublic.h \
+   $(srcdir)/H5Gprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Gpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Opublic.h \
+   $(srcdir)/H5Bprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Bpublic.h \
+   $(srcdir)/H5ACprivate.h \
+   $(srcdir)/H5ACpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Fprivate.h \
+   $(srcdir)/H5RSprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Dprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Oprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Spublic.h \
+   $(srcdir)/H5HGprivate.h \
+   $(srcdir)/H5HGpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Tprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Tpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Rprivate.h \
+   $(srcdir)/H5Rpublic.h \
+   $(srcdir)/H5Zprivate.h \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
    $(srcdir)/H5Fpkg.h \
    $(srcdir)/H5FOprivate.h \
    $(srcdir)/H5TBprivate.h \
    $(srcdir)/H5FDprivate.h \
+   $(srcdir)/H5FLprivate.h \
+   $(srcdir)/H5FPprivate.h \
    $(srcdir)/H5Iprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MFprivate.h \
    $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Pprivate.h \
-   $(srcdir)/H5Ppublic.h \
-   $(srcdir)/H5Vprivate.h
+   $(srcdir)/H5Pprivate.h
 H5FD.lo: \
    $(srcdir)/H5FD.c \
    $(srcdir)/H5private.h \
@@ -1069,9 +1123,9 @@ H5FL.lo: \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
    $(srcdir)/H5Epublic.h \
    $(srcdir)/H5Ipublic.h \
+   $(srcdir)/H5FLprivate.h \
    $(srcdir)/H5MMprivate.h \
-   $(srcdir)/H5MMpublic.h \
-   $(srcdir)/H5FLprivate.h
+   $(srcdir)/H5MMpublic.h
 H5FO.lo: \
    $(srcdir)/H5FO.c \
    $(srcdir)/H5Eprivate.h \
@@ -2418,7 +2472,6 @@ H5R.lo: \
    $(srcdir)/H5TBprivate.h \
    $(srcdir)/H5MMprivate.h \
    $(srcdir)/H5MMpublic.h \
-   $(srcdir)/H5Spkg.h \
    $(srcdir)/H5Sprivate.h \
    $(srcdir)/H5Pprivate.h \
    $(srcdir)/H5Ppublic.h
diff --git a/src/H5D.c b/src/H5D.c
index 8a53ae5..2fcb3af 100644
--- a/src/H5D.c
+++ b/src/H5D.c
@@ -3887,7 +3887,7 @@ H5Ddebug(hid_t dset_id, unsigned UNUSED flags)
     herr_t      ret_value=SUCCEED;      /* Return value */
 
     FUNC_ENTER_API(H5Ddebug, FAIL)
-    H5TRACE1("e","i",dset_id);
+    H5TRACE2("e","iIu",dset_id,flags);
 
     /* Check args */
     if (NULL==(dset=H5I_object_verify(dset_id, H5I_DATASET)))
diff --git a/src/Makefile.in b/src/Makefile.in
index 9a1b7d3..551f708 100644
--- a/src/Makefile.in
+++ b/src/Makefile.in
@@ -30,8 +30,8 @@ LIB=libhdf5.la
 DISTCLEAN=libhdf5.settings
 
 ## Source and object files for the library (lexicographically)...
-LIB_SRC=H5.c H5A.c H5AC.c H5B.c H5D.c H5Dio.c H5Dtest.c H5E.c H5F.c           \
-        H5Fcontig.c H5Fcompact.c H5Fistore.c H5Fseq.c H5FD.c H5FDcore.c       \
+LIB_SRC=H5.c H5A.c H5AC.c H5B.c H5D.c H5Dcontig.c H5Dcompact.c H5Dio.c        \
+        H5Distore.c H5Dseq.c H5Dtest.c H5E.c H5F.c H5FD.c H5FDcore.c          \
         H5FDfamily.c H5FDfphdf5.c H5FDgass.c H5FDlog.c H5FDmpio.c             \
         H5FDmpiposix.c H5FDmulti.c H5FDsec2.c H5FDsrb.c H5FDstdio.c           \
         H5FDstream.c H5FL.c H5FO.c H5FP.c H5FPclient.c H5FPserver.c H5FS.c    \
diff --git a/test/Dependencies b/test/Dependencies
index 522e0f7..3d93a9e 100644
--- a/test/Dependencies
+++ b/test/Dependencies
@@ -1787,7 +1787,21 @@ tmisc.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h \
-   $(srcdir)/h5test.h
+   $(srcdir)/h5test.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Dpkg.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5HGprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Tprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Gprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5RSprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Sprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h
 unlink.lo: \
    $(srcdir)/unlink.c \
    $(srcdir)/h5test.h \
diff --git a/testpar/Dependencies b/testpar/Dependencies
index c4b3563..94a8aba 100644
--- a/testpar/Dependencies
+++ b/testpar/Dependencies
@@ -18,10 +18,10 @@ t_mpi.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HGpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HLpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
@@ -29,9 +29,10 @@ t_mpi.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Tpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDcore.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDgass.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDlog.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmulti.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
@@ -40,21 +41,8 @@ t_mpi.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tpkg.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5HGprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Gprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5RSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Sprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h
+   $(top_srcdir)/test/testhdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h
 testphdf5.lo: \
    $(srcdir)/testphdf5.c \
    $(srcdir)/testphdf5.h \
@@ -72,10 +60,10 @@ testphdf5.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HGpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HLpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
@@ -83,9 +71,10 @@ testphdf5.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Tpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDcore.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDgass.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDlog.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmulti.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
@@ -94,21 +83,8 @@ testphdf5.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tpkg.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5HGprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Gprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5RSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Sprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h
+   $(top_srcdir)/test/testhdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h
 t_dset.lo: \
    $(srcdir)/t_dset.c \
    $(srcdir)/testphdf5.h \
@@ -126,10 +102,10 @@ t_dset.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HGpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HLpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
@@ -137,9 +113,10 @@ t_dset.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Tpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDcore.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDgass.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDlog.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmulti.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
@@ -148,21 +125,8 @@ t_dset.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tpkg.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5HGprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Gprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5RSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Sprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h
+   $(top_srcdir)/test/testhdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h
 t_file.lo: \
    $(srcdir)/t_file.c \
    $(srcdir)/testphdf5.h \
@@ -180,10 +144,10 @@ t_file.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HGpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HLpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
@@ -191,9 +155,10 @@ t_file.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Tpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDcore.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDgass.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDlog.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmulti.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
@@ -202,21 +167,8 @@ t_file.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tpkg.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5HGprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Gprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5RSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Sprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h
+   $(top_srcdir)/test/testhdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h
 t_mdset.lo: \
    $(srcdir)/t_mdset.c \
    $(srcdir)/testphdf5.h \
@@ -234,10 +186,10 @@ t_mdset.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HGpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5HLpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
@@ -245,9 +197,52 @@ t_mdset.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Tpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDcore.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDgass.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDlog.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmulti.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5private.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
+   $(top_srcdir)/test/testhdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h
+t_ph5basic.lo: \
+   $(srcdir)/t_ph5basic.c \
+   $(srcdir)/testphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/test/h5test.h \
+   $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5public.h \
+   $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5api_adpt.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Ipublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Apublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5ACpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5HGpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5HLpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Spublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Tpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDcore.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDgass.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDlog.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDmulti.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsec2.h \
@@ -256,18 +251,5 @@ t_mdset.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tpkg.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5HGprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Gprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5RSprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Tprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Sprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h
+   $(top_srcdir)/test/testhdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Eprivate.h
diff --git a/tools/h5dump/Dependencies b/tools/h5dump/Dependencies
index 524d121..ad14329 100644
--- a/tools/h5dump/Dependencies
+++ b/tools/h5dump/Dependencies
@@ -41,7 +41,8 @@ h5dump.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools.h \
-   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.h
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5trav.h
 h5dumpgentest.lo: \
    $(srcdir)/h5dumpgentest.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
diff --git a/tools/misc/Dependencies b/tools/misc/Dependencies
index e9adc5d..a428d38 100644
--- a/tools/misc/Dependencies
+++ b/tools/misc/Dependencies
@@ -8,20 +8,19 @@ h5debug.lo: \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
    $(top_srcdir)/src/H5api_adpt.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Iprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Ipublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Bprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5ACprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5ACpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Ipublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Pprivate.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Ppublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Dprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
-   $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDfphdf5.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpio.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5FDmpiposix.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Oprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Opublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Spublic.h \
@@ -35,12 +34,17 @@ h5debug.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Rprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Rpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Zprivate.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Zpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpkg.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FOprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5TBprivate.h \
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