[svn-r7352] Purpose:

    Updated dependencies

Platforms tested:
    h5committested

7 files changed, 65 insertions, 43 deletions

diff --git a/tools/gifconv/Dependencies b/tools/gifconv/Dependencies
index b3e6391..605720b 100644
--- a/tools/gifconv/Dependencies
+++ b/tools/gifconv/Dependencies
@@ -2,8 +2,8 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 decompress.lo: \
-   $(srcdir)/decompress.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/decompress.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -14,6 +14,7 @@ decompress.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -39,8 +40,8 @@ decompress.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 gif2hdf.lo: \
-   $(srcdir)/gif2hdf.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif2hdf.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -51,6 +52,7 @@ gif2hdf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -76,8 +78,8 @@ gif2hdf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 gif2mem.lo: \
-   $(srcdir)/gif2mem.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif2mem.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -88,6 +90,7 @@ gif2mem.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -113,8 +116,8 @@ gif2mem.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 gifread.lo: \
-   $(srcdir)/gifread.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gifread.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -125,6 +128,7 @@ gifread.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -150,8 +154,8 @@ gifread.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 hdf2gif.lo: \
-   $(srcdir)/hdf2gif.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/hdf2gif.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -162,6 +166,7 @@ hdf2gif.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -187,8 +192,8 @@ hdf2gif.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 hdfgifwr.lo: \
-   $(srcdir)/hdfgifwr.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/hdfgifwr.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -199,6 +204,7 @@ hdfgifwr.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -224,8 +230,8 @@ hdfgifwr.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 readhdf.lo: \
-   $(srcdir)/readhdf.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/readhdf.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -236,6 +242,7 @@ readhdf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -261,8 +268,8 @@ readhdf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 writehdf.lo: \
-   $(srcdir)/writehdf.c \
-   $(srcdir)/gif.h \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/writehdf.c \
+   $(top_srcdir)/tools/gifconv/gif.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -273,6 +280,7 @@ writehdf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
diff --git a/tools/h5diff/Dependencies b/tools/h5diff/Dependencies
index 7b2680d..2ac051f 100644
--- a/tools/h5diff/Dependencies
+++ b/tools/h5diff/Dependencies
@@ -2,7 +2,7 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 h5diff.lo: \
-   $(srcdir)/h5diff.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5diff/h5diff.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -13,6 +13,7 @@ h5diff.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -37,12 +38,12 @@ h5diff.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
-   $(srcdir)/h5trav.h \
+   $(top_srcdir)/tools/h5diff/h5trav.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h
 h5trav.lo: \
-   $(srcdir)/h5trav.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5diff/h5trav.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -53,6 +54,7 @@ h5trav.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -77,12 +79,12 @@ h5trav.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
-   $(srcdir)/h5trav.h \
+   $(top_srcdir)/tools/h5diff/h5trav.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h
 h5difftst.lo: \
-   $(srcdir)/h5difftst.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5diff/h5difftst.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -93,6 +95,7 @@ h5difftst.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
diff --git a/tools/h5dump/Dependencies b/tools/h5dump/Dependencies
index 1501a40..fe8d29f 100644
--- a/tools/h5dump/Dependencies
+++ b/tools/h5dump/Dependencies
@@ -2,8 +2,8 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 h5dump.lo: \
-   $(srcdir)/h5dump.c \
-   $(srcdir)/h5dump.h \
+   $(top_srcdir)/tools/h5dump/h5dump.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5dump/h5dump.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -14,6 +14,7 @@ h5dump.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -44,7 +45,7 @@ h5dump.lo: \
    $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools.h \
    $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.h
 h5dumpgentest.lo: \
-   $(srcdir)/h5dumpgentest.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5dump/h5dumpgentest.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -55,6 +56,7 @@ h5dumpgentest.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
diff --git a/tools/h5import/Dependencies b/tools/h5import/Dependencies
index c8b228e..2103653 100644
--- a/tools/h5import/Dependencies
+++ b/tools/h5import/Dependencies
@@ -2,7 +2,7 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 h5import.lo: \
-   $(srcdir)/h5import.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5import/h5import.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -13,6 +13,7 @@ h5import.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -40,9 +41,9 @@ h5import.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(srcdir)/h5import.h
+   $(top_srcdir)/tools/h5import/h5import.h
 h5importtest.lo: \
-   $(srcdir)/h5importtest.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5import/h5importtest.c \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
diff --git a/tools/h5ls/Dependencies b/tools/h5ls/Dependencies
index f39f0a4..3795339 100644
--- a/tools/h5ls/Dependencies
+++ b/tools/h5ls/Dependencies
@@ -2,7 +2,7 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 h5ls.lo: \
-   $(srcdir)/h5ls.c \
+   $(top_srcdir)/tools/h5ls/h5ls.c \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -17,6 +17,7 @@ h5ls.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
diff --git a/tools/lib/Dependencies b/tools/lib/Dependencies
index c300d0f..cd5100e 100644
--- a/tools/lib/Dependencies
+++ b/tools/lib/Dependencies
@@ -2,8 +2,8 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 h5tools.lo: \
-   $(srcdir)/h5tools.c \
-   $(srcdir)/h5tools.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools.c \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -14,6 +14,7 @@ h5tools.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -38,20 +39,20 @@ h5tools.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
-   $(srcdir)/h5tools_str.h \
-   $(srcdir)/h5tools_utils.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_str.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.h \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h
 h5tools_str.lo: \
-   $(srcdir)/h5tools_str.c \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_str.c \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
    $(top_srcdir)/src/H5api_adpt.h \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h \
-   $(srcdir)/h5tools.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Ipublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Apublic.h \
@@ -59,6 +60,7 @@ h5tools_str.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -83,10 +85,10 @@ h5tools_str.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
-   $(srcdir)/h5tools_str.h
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_str.h
 h5tools_utils.lo: \
-   $(srcdir)/h5tools_utils.c \
-   $(srcdir)/h5tools_utils.h \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.c \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools_utils.h \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -97,6 +99,7 @@ h5tools_utils.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -125,7 +128,7 @@ h5tools_utils.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h
 talign.lo: \
-   $(srcdir)/talign.c \
+   $(top_srcdir)/tools/lib/talign.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -136,6 +139,7 @@ talign.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -160,4 +164,4 @@ talign.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDsrb.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h \
-   $(srcdir)/h5tools.h
+   $(top_srcdir)/tools/lib/h5tools.h
diff --git a/tools/misc/Dependencies b/tools/misc/Dependencies
index 0a4086d..7d54b89 100644
--- a/tools/misc/Dependencies
+++ b/tools/misc/Dependencies
@@ -2,7 +2,7 @@
 ## Only temporary changes may be made here.
 
 h5debug.lo: \
-   $(srcdir)/h5debug.c \
+   $(top_srcdir)/tools/misc/h5debug.c \
    $(top_srcdir)/src/H5private.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -44,7 +44,7 @@ h5debug.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5MMpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDfamily.h
 h5createU8.lo: \
-   $(srcdir)/h5createU8.c \
+   $(top_srcdir)/tools/misc/h5createU8.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -55,6 +55,7 @@ h5createU8.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -80,7 +81,7 @@ h5createU8.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstdio.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDstream.h
 h5repart.lo: \
-   $(srcdir)/h5repart.c \
+   $(top_srcdir)/tools/misc/h5repart.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -91,6 +92,7 @@ h5repart.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \
@@ -119,7 +121,7 @@ h5repart.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5MPprivate.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FSprivate.h
 pdb2hdf.lo: \
-   $(srcdir)/pdb2hdf.c \
+   $(top_srcdir)/tools/misc/pdb2hdf.c \
    $(top_srcdir)/src/hdf5.h \
    $(top_srcdir)/src/H5public.h \
    $(top_builddir)/src/H5pubconf.h \
@@ -130,6 +132,7 @@ pdb2hdf.lo: \
    $(top_srcdir)/src/H5Bpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Dpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Epublic.h \
+   $(top_srcdir)/src/H5Epubgen.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Fpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5FDpublic.h \
    $(top_srcdir)/src/H5Gpublic.h \