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H5Oattr.c \ +H5O.o: \ + H5O.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ + H5ACprivate.h \ + H5ACpublic.h \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ + H5Ipublic.h \ H5Dpublic.h \ - H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ - H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h \ - H5Apkg.h -H5Ocont.o: \ - H5Ocont.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ H5Eprivate.h \ H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ + H5MFprivate.h \ + H5MFpublic.h \ H5MMprivate.h \ H5MMpublic.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Dpublic.h \ H5Gprivate.h \ H5Gpublic.h \ H5Bprivate.h \ @@ -279,21 +518,25 @@ H5Ocont.o: \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h -H5Olayout.o: \ - H5Olayout.c \ + H5Tpublic.h \ + H5Sprivate.h +H5Oattr.o: \ + H5Oattr.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ - H5Dprivate.h \ - H5Dpublic.h \ + H5Eprivate.h \ + H5Epublic.h \ H5Ipublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ H5Gprivate.h \ H5Gpublic.h \ H5Bprivate.h \ H5Bpublic.h \ + H5Fprivate.h \ + H5Fpublic.h \ + H5Dpublic.h \ + H5MMprivate.h \ + H5MMpublic.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ H5HGprivate.h \ @@ -302,9 +545,11 @@ H5Olayout.o: \ H5Tpublic.h \ H5Sprivate.h \ H5Spublic.h \ - H5Zprivate.h -H5Oname.o: \ - H5Oname.c \ + H5Zprivate.h \ + H5Zpublic.h \ + H5Apkg.h +H5Ocomp.o: \ + H5Ocomp.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ @@ -326,16 +571,20 @@ H5Oname.o: \ H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ H5Tpublic.h -H5Onull.o: \ - H5Onull.c \ +H5Ocont.o: \ + H5Ocont.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ + H5Eprivate.h \ + H5Epublic.h \ + H5Ipublic.h \ + H5MMprivate.h \ + H5MMpublic.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ - H5Ipublic.h \ H5Dpublic.h \ H5Gprivate.h \ H5Gpublic.h \ @@ -343,9 +592,10 @@ H5Onull.o: \ H5Bpublic.h \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h -H5Osdspace.o: \ - 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H5Gprivate.h -H5Tinit.o: \ - H5Tinit.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Iprivate.h \ - H5Ipublic.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ H5MMprivate.h \ H5MMpublic.h \ - H5Tpkg.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Tprivate.h -H5TB.o: \ - H5TB.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Iprivate.h \ - H5Ipublic.h \ - H5Eprivate.h -H5V.o: \ - H5V.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ H5Fprivate.h \ @@ -500,85 +713,63 @@ H5V.o: \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h -H5AC.o: \ - H5AC.c \ + H5Tpublic.h +H5Onull.o: \ + H5Onull.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ - H5ACprivate.h \ - H5ACpublic.h \ + H5Oprivate.h \ + H5Opublic.h \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ H5Ipublic.h \ H5Dpublic.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h -H5B.o: \ - H5B.c \ + H5Gprivate.h \ + H5Gpublic.h \ + H5Bprivate.h \ + H5Bpublic.h \ + H5HGprivate.h \ + H5HGpublic.h \ + H5Tprivate.h +H5Osdspace.o: \ + H5Osdspace.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ - 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H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ H5Tpublic.h -H5Sall.o: \ - H5Sall.c \ +H5Smpio.o: \ + H5Smpio.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ @@ -774,108 +944,19 @@ H5Spoint.o: \ H5Opublic.h \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h -H5T.o: \ - H5T.c \ +H5Sselect.o: \ + H5Sselect.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ - H5Dprivate.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Ipublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ - H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h \ - H5Iprivate.h \ H5Eprivate.h \ H5Epublic.h \ - H5MMprivate.h -H5G.o: \ - H5G.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ H5Ipublic.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Dprivate.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ - H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5Gpkg.h \ - H5ACprivate.h \ - H5ACpublic.h \ - H5HLprivate.h \ - H5HLpublic.h \ H5Iprivate.h \ - H5MMprivate.h -H5D.o: \ - H5D.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Iprivate.h \ - H5Ipublic.h \ - H5ACprivate.h \ - H5ACpublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Dprivate.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h \ + H5MMprivate.h \ + H5MMpublic.h \ H5Sprivate.h \ H5Spublic.h \ - H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5HLprivate.h \ - H5HLpublic.h \ - H5MFprivate.h \ - H5MFpublic.h -H5F.o: \ - H5F.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Aprivate.h \ - H5Apublic.h \ - H5Ipublic.h \ H5Gprivate.h \ H5Gpublic.h \ H5Bprivate.h \ @@ -883,26 +964,16 @@ H5F.o: \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ H5Dpublic.h \ - H5Dprivate.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ H5Tpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h \ - H5Iprivate.h \ - H5ACprivate.h \ - H5ACpublic.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h -H5Fistore.o: \ - H5Fistore.c \ + H5Zpublic.h +H5T.o: \ + H5T.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ @@ -925,76 +996,53 @@ H5Fistore.o: \ H5Spublic.h \ H5Zprivate.h \ H5Zpublic.h \ + H5Iprivate.h \ H5Eprivate.h \ H5Epublic.h \ - H5MFprivate.h \ - H5MFpublic.h -H5Flow.o: \ - H5Flow.c \ + H5MMprivate.h +H5Tbit.o: \ + H5Tbit.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ H5Eprivate.h \ H5Epublic.h \ H5Ipublic.h \ + H5Iprivate.h \ + H5Tpkg.h \ + H5HGprivate.h \ + H5HGpublic.h \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ H5Dpublic.h \ - H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h -H5Fmpio.o: \ - H5Fmpio.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ - H5Dprivate.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ H5Tpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ - H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h \ - H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h -H5Omtime.o: \ - H5Omtime.c \ - H5private.h \ + H5Gprivate.h +H5Tconv.o: \ + H5Tconv.c \ + H5Iprivate.h \ + H5Ipublic.h \ H5public.h \ H5config.h \ + H5private.h \ H5Eprivate.h \ H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ H5MMprivate.h \ H5MMpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ + H5Tpkg.h \ + H5HGprivate.h \ + H5HGpublic.h \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ H5Dpublic.h \ + H5Tprivate.h \ + H5Tpublic.h \ H5Gprivate.h \ H5Gpublic.h \ H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h -H5S.o: \ - H5S.c \ + H5Bpublic.h +H5Tinit.o: \ + H5Tinit.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ @@ -1004,79 +1052,29 @@ H5S.o: \ H5Epublic.h \ H5MMprivate.h \ H5MMpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ + H5Tpkg.h \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h -H5Shyper.o: \ - H5Shyper.c \ - H5private.h \ - H5public.h \ - H5config.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ H5Fprivate.h \ H5Fpublic.h \ H5Dpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h -H5Sselect.o: \ - H5Sselect.c \ + H5Tprivate.h +H5TB.o: \ + H5TB.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ - H5Eprivate.h \ - H5Epublic.h \ - H5Ipublic.h \ H5Iprivate.h \ - H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h \ - H5Sprivate.h \ - H5Spublic.h \ - H5Gprivate.h \ - H5Gpublic.h \ - H5Bprivate.h \ - H5Bpublic.h \ - H5Fprivate.h \ - H5Fpublic.h \ - H5Dpublic.h \ - H5Oprivate.h \ - H5Opublic.h \ - H5HGprivate.h \ - H5HGpublic.h \ - H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h \ - H5Zprivate.h \ - H5Zpublic.h -H5Ocomp.o: \ - H5Ocomp.c \ + H5Ipublic.h \ + H5Eprivate.h +H5V.o: \ + H5V.c \ H5private.h \ H5public.h \ H5config.h \ H5Eprivate.h \ H5Epublic.h \ H5Ipublic.h \ - H5MMprivate.h \ - H5MMpublic.h \ H5Oprivate.h \ H5Opublic.h \ H5Fprivate.h \ @@ -1089,7 +1087,9 @@ H5Ocomp.o: \ H5HGprivate.h \ H5HGpublic.h \ H5Tprivate.h \ - H5Tpublic.h + H5Tpublic.h \ + H5Sprivate.h \ + H5Spublic.h H5Z.o: \ H5Z.c \ H5private.h \ @@ -695,7 +695,7 @@ HDfprintf (FILE *stream, const char *fmt, ...) case 'c': if (1) { - char x = va_arg (ap, char); + char x = (char)va_arg (ap, int); n = fprintf (stream, template, x); } break; diff --git a/src/H5Distore.c b/src/H5Distore.c index dcea323..efeb7d7 100644 --- a/src/H5Distore.c +++ b/src/H5Distore.c @@ -877,7 +877,7 @@ H5F_istore_preempt (H5F_t *f, intn idx) H5F_istore_flush_entry (f, ent, TRUE); HDmemmove (rdcc->slot+idx, rdcc->slot+idx+1, - (rdcc->nused-idx) * sizeof(H5F_rdcc_ent_t)); + (rdcc->nused-(idx+1)) * sizeof(H5F_rdcc_ent_t)); rdcc->nused -= 1; rdcc->nbytes -= ent->chunk_size; @@ -911,9 +911,6 @@ H5F_istore_dest (H5F_t *f) FUNC_ENTER (H5F_istore_dest, FAIL); for (i=rdcc->nused-1; i>=0; --i) { - if (H5F_istore_flush_entry (f, rdcc->slot+i, TRUE)<0) { - nerrors++; - } if (H5F_istore_preempt(f, i)<0) { nerrors++; } diff --git a/src/H5Fistore.c b/src/H5Fistore.c index dcea323..efeb7d7 100644 --- a/src/H5Fistore.c +++ b/src/H5Fistore.c @@ -877,7 +877,7 @@ H5F_istore_preempt (H5F_t *f, intn idx) H5F_istore_flush_entry (f, ent, TRUE); HDmemmove (rdcc->slot+idx, rdcc->slot+idx+1, - (rdcc->nused-idx) * sizeof(H5F_rdcc_ent_t)); + (rdcc->nused-(idx+1)) * sizeof(H5F_rdcc_ent_t)); rdcc->nused -= 1; rdcc->nbytes -= ent->chunk_size; @@ -911,9 +911,6 @@ H5F_istore_dest (H5F_t *f) FUNC_ENTER (H5F_istore_dest, FAIL); for (i=rdcc->nused-1; i>=0; --i) { - if (H5F_istore_flush_entry (f, rdcc->slot+i, TRUE)<0) { - nerrors++; - } if (H5F_istore_preempt(f, i)<0) { nerrors++; } @@ -142,7 +142,7 @@ H5HG_create (H5F_t *f, size_t size) UINT16ENCODE(p, 0); /*reference count*/ UINT32ENCODE(p, 0); /*reserved*/ H5F_encode_length (f, p, heap->obj[0].size); - HDmemset (p, 0, (size_t)((heap->chunk+heap->nalloc) - p)); + HDmemset (p, 0, (size_t)((heap->chunk+heap->size) - p)); /* Add the heap to the cache */ if (H5AC_set (f, H5AC_GHEAP, &addr, heap)<0) { @@ -87,7 +87,10 @@ hid_t H5T_NATIVE_B16_g = FAIL; hid_t H5T_NATIVE_B32_g = FAIL; hid_t H5T_NATIVE_B64_g = FAIL; hid_t H5T_NATIVE_OPAQUE_g = FAIL; - +hid_t H5T_NATIVE_HSIZE_g = FAIL; +hid_t H5T_NATIVE_HSSIZE_g = FAIL; +hid_t H5T_NATIVE_HERR_g = FAIL; +hid_t H5T_NATIVE_HBOOL_g = FAIL; /* The path database */ static intn H5T_npath_g = 0; /*num paths defined */ @@ -187,7 +190,35 @@ H5T_init_interface(void) HRETURN_ERROR(H5E_DATATYPE, H5E_CANTINIT, FAIL, "unable to initialize H5T layer"); } + + /* hsize_t */ + dt = H5I_object (H5T_NATIVE_HSIZE_g = H5Tcopy (H5T_NATIVE_UINT_g)); + dt->state = H5T_STATE_IMMUTABLE; + dt->size = sizeof(hsize_t); + dt->u.atomic.prec = 8*dt->size; + dt->u.atomic.offset = 0; + + /* hssize_t */ + dt = H5I_object (H5T_NATIVE_HSSIZE_g = H5Tcopy (H5T_NATIVE_INT_g)); + dt->state = H5T_STATE_IMMUTABLE; + dt->size = sizeof(hssize_t); + dt->u.atomic.prec = 8*dt->size; + dt->u.atomic.offset = 0; + /* herr_t */ + dt = H5I_object (H5T_NATIVE_HERR_g = H5Tcopy (H5T_NATIVE_INT_g)); + dt->state = H5T_STATE_IMMUTABLE; + dt->size = sizeof(herr_t); + dt->u.atomic.prec = 8*dt->size; + dt->u.atomic.offset = 0; + + /* hbool_t */ + dt = H5I_object (H5T_NATIVE_HBOOL_g = H5Tcopy (H5T_NATIVE_INT_g)); + dt->state = H5T_STATE_IMMUTABLE; + dt->size = sizeof(hbool_t); + dt->u.atomic.prec = 8*dt->size; + dt->u.atomic.offset = 0; + /*------------------------------------------------------------ * IEEE Types *------------------------------------------------------------ diff --git a/src/H5Tpublic.h b/src/H5Tpublic.h index f9d417b..8f72510 100644 --- a/src/H5Tpublic.h +++ b/src/H5Tpublic.h @@ -342,6 +342,10 @@ extern hid_t H5T_FORTRAN_S1_g; #define H5T_NATIVE_B32 (H5open(), H5T_NATIVE_B32_g) #define H5T_NATIVE_B64 (H5open(), H5T_NATIVE_B64_g) #define H5T_NATIVE_OPAQUE (H5open(), H5T_NATIVE_OPAQUE_g) +#define H5T_NATIVE_HSIZE (H5open(), H5T_NATIVE_HSIZE_g) +#define H5T_NATIVE_HSSIZE (H5open(), H5T_NATIVE_HSSIZE_g) +#define H5T_NATIVE_HERR (H5open(), H5T_NATIVE_HERR_g) +#define H5T_NATIVE_HBOOL (H5open(), H5T_NATIVE_HBOOL_g) extern hid_t H5T_NATIVE_CHAR_g; extern hid_t H5T_NATIVE_UCHAR_g; extern hid_t H5T_NATIVE_SHORT_g; @@ -360,8 +364,11 @@ extern hid_t H5T_NATIVE_B16_g; extern hid_t H5T_NATIVE_B32_g; extern hid_t H5T_NATIVE_B64_g; extern hid_t H5T_NATIVE_OPAQUE_g; - - +extern hid_t H5T_NATIVE_HSIZE_g; +extern hid_t H5T_NATIVE_HSSIZE_g; +extern hid_t H5T_NATIVE_HERR_g; +extern hid_t H5T_NATIVE_HBOOL_g; + /* Operations defined on all data types */ hid_t H5Topen (hid_t loc_id, const char *name); hid_t H5Tcreate (H5T_class_t type, size_t size); diff --git a/test/.distdep b/test/.distdep index c16495f..b04981b 100644 --- a/test/.distdep +++ b/test/.distdep @@ -423,8 +423,8 @@ mtime.o: \ ../src/H5Spublic.h \ ../src/H5Tpublic.h \ ../src/H5private.h -dsets.o: \ - dsets.c \ +links.o: \ + links.c \ ../src/hdf5.h \ ../src/H5public.h \ ../src/H5config.h \ @@ -445,8 +445,8 @@ dsets.o: \ ../src/H5Zpublic.h \ ../src/H5Spublic.h \ ../src/H5Tpublic.h -links.o: \ - links.c \ +dtypes.o: \ + dtypes.c \ ../src/hdf5.h \ ../src/H5public.h \ ../src/H5config.h \ @@ -466,9 +466,14 @@ links.o: \ ../src/H5Ppublic.h \ ../src/H5Zpublic.h \ ../src/H5Spublic.h \ - ../src/H5Tpublic.h -dtypes.o: \ - dtypes.c \ + ../src/H5Tpublic.h \ + ../src/H5Tpkg.h \ + ../src/H5HGprivate.h \ + ../src/H5Fprivate.h \ + ../src/H5private.h \ + ../src/H5Tprivate.h +dsets.o: \ + dsets.c \ ../src/hdf5.h \ ../src/H5public.h \ ../src/H5config.h \ @@ -488,9 +493,4 @@ dtypes.o: \ ../src/H5Ppublic.h \ ../src/H5Zpublic.h \ ../src/H5Spublic.h \ - ../src/H5Tpublic.h \ - ../src/H5Tpkg.h \ - ../src/H5HGprivate.h \ - ../src/H5Fprivate.h \ - ../src/H5private.h \ - ../src/H5Tprivate.h + ../src/H5Tpublic.h diff --git a/test/dsets.c b/test/dsets.c index 7171b18..cb27004 100644 --- a/test/dsets.c +++ b/test/dsets.c @@ -814,8 +814,6 @@ main(void) H5Gset_comment(grp, ".", "Causes diagnostic messages to be emitted"); H5Gclose (grp); - - status = test_create(file); nerrors += status < 0 ? 1 : 0; @@ -824,7 +822,7 @@ main(void) status = test_tconv(file); nerrors += status < 0 ? 1 : 0; - + status = test_compression(file); nerrors += status < 0 ? 1 : 0; |